Το Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων έχει σήμερα είκοσι τρία (23) Τμήματα, στα οποία φοιτούν τριάντα δύο χιλιάδες επτακόσιοι δεκατέσσερις (32.714) φοιτητές.
Οργανωμένα Τμήματα Μεταπτυχιακών Σπουδών λειτουργούν στις περισσότερες Σχολές του Πανεπιστημίου, με αριθμό φοιτητών που φθάνει τους χίλιους διακόσιους εβδομήντα έναν (1271), ενώ αντίστοιχα χίλιοι πεντακόσιοι ενενήντα οκτώ (1598) φοιτητές εκπονούν διδακτορική διατριβή και εκατόν εξήντα τρεις (163) μεταδιδακτορική έρευνα. Οι αριθμοί αυτοί μεταβάλλονται ετησίως.
Τα μέλη του Διδακτικού Ερευνητικού Προσωπικού (Δ.Ε.Π.) ανέρχονται στα πεντακόσια σαράντα οκτώ (548) και τα μέλη του Ειδικού Εκπαιδευτικού Προσωπικού (Ε.Ε.Π.) σε δώδεκα (12). Το Εργαστηριακό Διδακτικό Προσωπικό (Ε.ΔΙ.Π.) έχει συνολικά εκατόν δεκαεννέα (119) μέλη ενώ κατά το εαρινό εξάμηνο του ακαδημαϊκού έτους 2024-2025 απασχολούνται στο Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων εκατόν τρεις (103) εντεταλμένοι διδάσκοντες.
Στις διοικητικές υπηρεσίες του Πανεπιστημίου εργάζονται διακόσιοι ενενήντα δύο (292) υπάλληλοι, καθώς και τρεις (3) δικηγόροι με έμμισθη εντολή. Τέλος, το Ειδικό Τεχνικό Εργαστηριακό Προσωπικό (Ε.Τ.Ε.Π.) αποτελείται από σαράντα οκτώ (48) μέλη.
Σημαντικά βήματα στην οργάνωση του Πανεπιστημίου αποτέλεσαν η δημοσίευση του Οργανισμού Διοικητικών Υπηρεσιών και του Εσωτερικού Κανονισμού Λειτουργίας του ιδρύματος.
Ο Οργανισμός του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων δημοσιεύτηκε στο ΦΕΚ 173/1999, τεύχος Α΄, και έκτοτε έχει επικαιροποιηθεί περιοδικά, προκειμένου να εναρμονιστεί με αλλαγές στη νομοθεσία και να συμπληρωθεί με νέες διοικητικές υπηρεσίες, με πιο πρόσφατη τροποποίησή του την ίδρυση της Μονάδας Στρατηγικού Σχεδιασμού (ΦΕΚ 317/2025, τεύχος Β΄).
Ο Εσωτερικός Κανονισμός Λειτουργίας του Πανεπιστημίου Ιωαννίνων δημοσιεύτηκε στο ΦΕΚ 310/2005, τεύχος Β’, και αποτέλεσε σημαντικό θεσμικό εργαλείο σε ό,τι αφορά στην οργάνωση των διαδικασιών και τη θέσπιση κανόνων προκειμένου να ρυθμίζονται θέματα που δεν ρυθμίζονται από την εκάστοτε ισχύουσα πανεπιστημιακή νομοθεσία.
Τα τελευταία χρόνια, με την ίδρυση νέων Τμημάτων και την ένταξη του ΤΕΙ Ηπείρου (ν. 4559/2018), το Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων έχει σχεδόν διπλασιαστεί και η προοπτική εξέλιξής του παρουσιάζεται ιδιαίτερα ευοίωνη. Το γεγονός αυτό θα έχει θετικές επιπτώσεις όχι μόνο στην πανεπιστημιακή κοινότητα αλλά και σε ολόκληρη την περιοχή.
Ο τόπος της Ηπείρου ήταν γεμάτος από ιστορικές αναμνήσεις, καθώς οι πνευματικές παραδόσεις του Γένους είχαν διατηρηθεί και είχαν συντελέσει στην αποκρυστάλλωση εθνικής συνείδησης. Η πόλη σε όλη τη διάρκεια της τουρκοκρατίας είχε κατορθώσει να διατηρήσει πολιτιστική αυτονομία και να χαράξει τον δρόμο της εθνικής ανάτασης. Όμως, τα Ιωάννινα, όπως και ολόκληρη η Ήπειρος δεν μπόρεσαν να υπαχθούν στην ελληνική επικράτεια. Η ενσωμάτωσή τους έγινε μόλις το 1912-13. Η ηπειρωτική γη επρόκειτο να δοκιμαστεί και κατά τη διάρκεια του δεύτερου Παγκόσμιου Πολέμου, στα κατοχικά χρόνια και στον εμφύλιο. Βρήκε ωστόσο τη δύναμη να αντέξει και να διεκδικήσει τη θέση, η οποία της ανήκε στην ελληνική κοινωνία.
Οι προσπάθειες για την ίδρυση Πανεπιστημίου στα Ιωάννινα και στην ευρύτερη περιοχή μαρτυρούνται από τα τελευταία προεπαναστατικά χρόνια. Εκείνη την περίοδο, επιφανείς Ηπειρώτες διανοούμενοι είχαν επιχειρήσει να ιδρύσουν πανεπιστημιακές Σχολές στην Ήπειρο.
Από τις αρχές του ’50 και αμέσως μετά την ίδρυση της Εταιρείας Ηπειρωτικών Μελετών (1954), υπήρχε έντονο το αίτημα για την ίδρυση ενός Ανώτατου Εκπαιδευτικού Ιδρύματος, που θα επιβεβαίωνε το πολιτιστικό παρελθόν της Ηπείρου και θα αναδείκνυε από κάθε άποψη τα Ιωάννινα και την ευρύτερη περιοχή.
Το 1962 συγκροτήθηκε στην Αθήνα Κεντρική Επιτροπή Αγώνος Πανεπιστημίου Ιωαννίνων, με μοναδικό σκοπό «την αποτελεσματικωτέραν διεκδίκησιν και ευρυτέραν δυνατήν προβολήν του δικαίου ηπειρωτικού αιτήματος της ίδρυσης εις τα Ιωάννινα του Γ’ Πανεπιστημίου ή ανεξαρτήτων μετεκπαιδευτικών θεωρητικών ή τεχνικών σχολών». Σε προκήρυξή της, η Επιτροπή, τον Ιούλιο του 1962, καλούσε κάθε επίσημο και ανεπίσημο φορέα, όπως και κάθε Ηπειρώτη, να δραστηριοποιηθούν για την υλοποίηση του παραπάνω αιτήματος.